Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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