Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms