Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms