Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms