Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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