Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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SNAPC1Q16533 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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