Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FRMPD4Q14CM0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms