Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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