Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EFR3AQ14156 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms