Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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CNGB1Q14028 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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CNGB1Q14028 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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CNGB1Q14028 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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CNGB1Q14028 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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CNGB1Q14028 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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CNGB1Q14028 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CNGB1Q14028 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CNGB1Q14028 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CNGB1Q14028 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CNGB1Q14028 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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