Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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