Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ATP1A4Q13733 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ATP1A4Q13733 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ATP1A4Q13733 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ATP1A4Q13733 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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