Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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