Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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IKZF1Q13422 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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