Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CALCOCO2Q13137 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CALCOCO2Q13137 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CALCOCO2Q13137 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CALCOCO2Q13137 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CALCOCO2Q13137 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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