Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms