Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP3CAQ08209 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms