Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms