Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms