Protein–RNA interactions for Protein: Q01851

POU4F1, POU domain, class 4, transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1Q01851 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POU4F1Q01851 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU4F1Q01851 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms