Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms