Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP46P62068 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
USP46P62068 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP46P62068 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP46P62068 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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