Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms