Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms