Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUFMP49411 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUFMP49411 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUFMP49411 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUFMP49411 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUFMP49411 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUFMP49411 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUFMP49411 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUFMP49411 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUFMP49411 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUFMP49411 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUFMP49411 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUFMP49411 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUFMP49411 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUFMP49411 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUFMP49411 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms