Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms