Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 327.1 ms