Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms