Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFC1P35251 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFC1P35251 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFC1P35251 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFC1P35251 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFC1P35251 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFC1P35251 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFC1P35251 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFC1P35251 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFC1P35251 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFC1P35251 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFC1P35251 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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