Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFNP31947 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFNP31947 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFNP31947 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFNP31947 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms