Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NTF3P20783 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NTF3P20783 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms