Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPD1P17405 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms