Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRAFP15056 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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