Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZBED1O96006 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZBED1O96006 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZBED1O96006 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZBED1O96006 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZBED1O96006 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZBED1O96006 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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