Protein–RNA interactions for Protein: O95415

BRI3, Brain protein I3, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRI3O95415 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRI3O95415 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms