Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SEC24DO94855 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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