Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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