Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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CTDSP2O14595 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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CTDSP2O14595 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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CTDSP2O14595 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTDSP2O14595 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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