Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms