Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6BA6NDN3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6BA6NDN3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms