Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms