Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms