Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHKBQ9Y259 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms