Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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