Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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