Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms