Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms