Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDIT4Q9NX09 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDIT4Q9NX09 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms