Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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