Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

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Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATAD3AQ9NVI7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATAD3AQ9NVI7 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATAD3AQ9NVI7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATAD3AQ9NVI7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATAD3AQ9NVI7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATAD3AQ9NVI7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATAD3AQ9NVI7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATAD3AQ9NVI7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATAD3AQ9NVI7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATAD3AQ9NVI7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATAD3AQ9NVI7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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